Menu Cadastros > Condições de Pagamento
Para habilitar a opção com Entrada:
O tipo deve ser Parcelado - Valores Iguais.
A opção Usar 1º vencimento deve estar habilitada.
Com isso a opção com entrada poderá ser habilitada pelo usuário.
Lembrando que a opção Usar 1º vencimento utiliza o primeiro como referência.
Exemplo:
Com a opção de entrada:
Sem a opção de com entrada: